регистрация по месту пребывания в СЖП членов семьи не включённых в договор

Добрый вечер! имеет ли право начальник территориального отдела ЗРУЖО препятствовать регистрации моей супруге по месту пребывания в служебной квартире, полученной от МО по договору найма сл.жилого помещения, если на нее жилая площадь не распределялась, мы на нее не претендуем, но органы ПВС МВД ей отказали в регистрации по месту пребывания, т.к. она имела постоянную регистрацию в квартире отца!
В 2014 году при получении 1-й служебной квартиры (54 кв. м.) , УФМС не препятствовало такой регистрации вместе с мужем и 2-мя несовершеннолетними детьми, теперь при получении 3-х комнатной квартиры по законным основаниям у меня на доп.жил.площадь в ЗРУЖО сказали дословно: идите и прописывайтесь как хотите, она в договор не входит, регистрировать ее там нельзя. Что нам теперь делать с этим?